El paisaje minero se ha ido renaturalizando tras el abandono de la actividad minera. La mejora de su biodiversidad es visible en la convivencia de plantaciones forestales con bosque mixto atlántico y de ribera. Además se han consolidado los humedales de Barnaola y Apaolaza y la charca de Mañastegizahar. En este entorno el paisaje minero y natural coexiste con la actividad agropecuaria.
El río Troi, también llamado Peatza, vertebra la zona minera. Surge en las entrañas de la mina Troi, a unos 500 m de altura. Situado en la cabecera de la cuenca del Oria conforma un valle cerrado con vegetación de ribera bien conservada, alisos, avellanos, fresnos e interesante fauna asociada. En el casco de Mutiloa se une a la regata Aizpea para convertirse en Mutiloa erreka, y ya en Segura, vierte sus aguas en el río Oria.
Históricamente su caudal y su fuerza han sido utilizadas para las actividades humanas en diferentes etapas: molinos harineros como los de Troi, Orue y Lenkaran; los lavaderos de mineral de Mañastegizahar, Troi y Barnaola, y las turbinas instaladas en la central de Lenkaran y en el dique cercano a Barnaola.
Paralelamente la actividad minera generó en el paisaje pequeñas cubetas que con el paso del tiempo se han ido rellenando de sedimentos finos impermeables y al encharcarse el suelo se han formado pequeños humedales y prados juncales. Son importantes refugios y lugares de cría para la fauna, en especial para los anfibios, entre los que destacan el tritón palmeado y la rana bermeja. Junto a estos humedales se han detectado especies de interés. Entre los musgos aparecen Cryphaea heteromalla. Ilex aquifolium y Ruscus aculeatus, son dos especies vasculares protegidas por ley. Es también curiosa la presencia de plantas parásitas (Lathraea clandestina y Viscum album), o los ejemplares de buen tamaño, como el saúco (Sambucus nigra), así como los bosquetes (la fresneda de Barnaola o la aliseda – fresneda de Mañastegizahar). Existen helechos como (Asplenium scolopendrium, Athyrium filix-femina, Dryopteris affinis y Polystichum setiferum) o Sanicula europaea.